Huỳnh Quốc Việt sinh ngày 25 tháng 9 năm 1976 tại Phường 6, thành phố Cà Mau, tỉnh Minh Hải (nay là tỉnh Cà Mau), nguyên quán tại xã Tân Thành (nay là phường Tân Thành), thành phố Cà Mau. Ông lớn lên và theo học phổ thông tại quê nhà. Sau khi tốt nghiệp phổ thông 12/12, ông tới Thành phố Hồ Chí Minh theo học đại học, ngành xây dựng, tốt nghiệp Kỹ sư Xây dựng chuyên ngành Kỹ thuật công trình vào năm 1998, đồng thời thông thạo tiếng Anh. Tháng 5 năm 2013, ông tới thủ đô Hà Nội, theo học cao học ngành Kỹ thuật Xây dựng công trình Giao thông tại Trường Đại học Xây dựng Hà Nội, nhận bằng Thạc sĩ chuyên ngành Xây dựng cầu hầm năm 2015.[3]

Ngày 2 tháng 4 năm 2003, ông được kết nạp Đảng Cộng sản Việt Nam, trở thành đảng viên chính thức vào ngày 2 tháng 4 năm 2004. Trong quá trình hoạt động Đảng và Nhà nước, ông theo học các khóa tại Học viện Chính trị Quốc gia Hồ Chí Minh, nhận bằng Cao cấp lý luận chính trị. Nay, ông thường trú tại số 179 đường Lý Thường Kiệt, khóm 7, Phường 6, thành phố Cà Mau, tỉnh Cà Mau.